產品詳情
簡單介紹：
轉錄組測序：上海達為科生物，主營實驗技術服務，如想了解更多轉錄組測序內容，歡迎來電咨詢！
詳情介紹：
利用新一代高通量測序技術進行轉錄組測序，并結合生物信息學的預測工具進行lncRNA分析，有助于科研工作者更快更有效率的發現那些具有重要調控功能的lncRNA，分析其與特定生物學過程或者疾病的關系，促進lncRNA的深入研究。
lncRNA深度挖掘分析
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差異lncRNA靶基因預測
lncRNA的靶基因較為復雜,主要分為正式和反式兩種作用機制.lncRNA作用機制與miRNA類似,均可以通過調控相應的mRNA來行使功能,所以靶基因的預測在科學研究中都顯得非常必要。
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靶基因Gene Ontology分析
我們將靶基因向gene ontology數據庫的各節點映射,計算每個節點的基因數目.
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靶基因Pathway分析
信號通路分析需要完備的注釋信息支持，通過整合KEGG、Biocarta、Reactome等多個數據庫的信息可以檢驗來進行Pathway的顯著性分析。
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lncRNA與調控基因的表達機制
通過整合lncRNA的信息和靶基因之間的關系,我們可以得到一個lncRNA與靶基因之間的調控網絡圖.
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轉錄因子結合位點預測
對于差異表達lncRNA，提取轉錄起始位點上下游序列,使用預測程序對其轉錄因子結合位點進行預測.
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基因關聯分析
現在市面上的lncRNA芯片均含有mRNA的表達探針,通過將lncRNA的靶基因分析結果與芯片上mRNA的表達結果做關聯分析,可以更進一步的分析lncRNA的功能。
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信號通路調控網絡構建：
實驗中基因同時參與了很多Pathway，通過構建信號通路調控網絡，從宏觀層面看到Pathway之間的信號傳遞關系，在多個顯著性Pathway中發現受實驗影響的核心Pathway，以及實驗影響的信號通路之間的調控機理。
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lncRNA的功能分析
根據lncRNA的功能數據庫，利用生物信息學工具，做出Function-Tar-Net圖表，從而得出lncRNA與功能的關系
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